1.2.1 資產安全問題
對于中心化的交易所而言，用戶的資金都托管在交易所，很容易受到黑客入侵或是內部人員監守自盜導致加密貨幣失竊等交易所安全事故的發生，以及一些代幣智能合約安全漏洞導致被利用產生資金損失。
近幾年，交易所安全事故頻發，Mt.Gox、Poloniex、Bitstamp、Bitfinex、Bithumb等都遭受過安全問題，無論對于交易平臺還是普通用戶來說，都是重大損失。
1.2.2 缺乏信任和透明度
從理論上來說，中心化交易平臺無法避免黑客攻擊、盜幣等各類平臺安全問題，只能通過加強安全防護和技術手段，通過高強度的風控體系方式來盡量避免安全問題，保護用戶的賬號和資產安全。
中心化交易所，實際的交易成本和過程是不透明的，極易出現平臺刷單、機器人交易等造成虛假成交量，惡意操縱市場，任意修改交易規則等行為，嚴重損害交易者的合法權益。
1.2.3 高昂上幣費
項目方眾籌完畢后上架交易所，一般需要繳納上幣費，之前火幣hadax前幾期的上幣費高達千萬RMB，對于項目方來說，相當于籌集資金的1/10-1/5，而上幣費用，最終會通過代幣交易轉嫁到交易者身上。
1.2.4 政府監管
隨著數字貨幣市場的火熱，各國加強了對數字貨幣市場的監管，交易所面臨著合法性的問題和法律風險。各中心化交易所一方面在搶占市場份額，另一方面也在申請各國的合法牌照。
目前，毫無疑問，中心化交易所依舊是數字貨幣交易市場的主力軍。因為，對于絕大多數用戶來說，交易體驗好（如交易速度快，深度高，幣種全，市場活躍等因素）的重要性遠超過對可能發生安全事件的擔憂。很多中心化交易所，在提高用戶體驗的同時也增大了安全保護方面的投入，也在一定程度上減少或打消了部分用戶的顧慮。
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