IOTA：
1. MIT報告指出，IOTA使用了自己開發的哈希算法curl，但是curl算法的哈希值極易發生碰撞，于是就能偽造數字簽名。
2. 因為共識是由全網交易確定的，那么理論上來說，如果有人能夠產生1/3的交易量，他就可以將無效交易變成有效交易。另一方面，由于IOTA無手續費，所以沒有礦工激勵，IOTA面臨著拒絕服務攻擊和垃圾信息攻擊可能，就像不收物業費的小區，靠業主自治很難掃清不法份子。
3. IOTA引入閉源的中心化組件Coordinator來對全網交易進行檢查（例如雙花），如何有效移除Coordinator并建立一個具有良性激勵機制的去中心化「Coordinator群體」，IOTA還沒有給出解決方案。
Byteball：
由于主鏈算法和見證人發布頻率有關系，交易確認的時間是不確定的；由于Byteball基于關系數據庫來存儲數據，SQL語言過于緊耦合算法邏輯，在一定程度上限制了Byteball目前的擴展能力和速度。
NANO：
沒有被充分測試、缺乏同行評議，共識算法可能有嚴重缺陷的風險。例如，如果沒有足夠的法定人數投票來解決網絡沖突會發生什么？如果NANO網絡的某些部分長時間分離，當分離的網絡重新加入時會發生什么？重新加入的網絡是否會在不可避免發生的投票過程中癱瘓？這些問題都有待測試驗證。
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