碳普惠是政府部門、數字平臺企業、
金融機構、第三方機構、科研院所、高校等多元主體參與的跨部門跨行業創新。王曉霞表示，多元主體間的交易成本高，有效推動多元主體的協作創新是探索碳普惠的挑戰之一。與此同時，交通碳普惠的條件與城市背景情況有關，要考慮人口狀況、交通基礎設施、城市交通出行特點、城市數字化基礎、社會活力等多重因素。
在
上海方融科技有限責任公司首席運營官任健看來，碳普惠落地過程中要做好頂層設計，包括碳普惠核算方法學和場景設計，并用數字化的方式量化居民相關行為的數據。數據源由不同主體掌握，行為數據的獲取是一個挑戰，尤其在超大規模城市中，數據源的獲取不只是技術挑戰，還需要多元主體的協調。此外，碳普惠平臺的可持續運行需要一套經濟機制。“平臺運營方鏈接個人主體，個人需要被激勵才有動力持續做碳普惠所鼓勵的綠色
低碳行為，對個人的經濟補償來自哪里？現在這些商業模式并不是非常清晰，仍在探索過程中。”
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