中心化交易所掌握著大量的
數字貨幣資產，據統計，有73%的交易所保管了用戶的密鑰，只有23%的交易所讓用戶自己控制密鑰，交易所極易成為黑客攻擊的對象。因此，資金安全和信息安全是數字貨幣交易所賴以生存的基礎。
數字貨幣交易所是一門相對年輕的生意，技術能力的不足和經營經驗的缺乏都會讓交易所遭受事故。下表列出了數字貨幣交易歷史上最知名的安全事故，頻頻發生的安全事故不斷消耗著用戶對中心化交易所的信任。
交易所安全系統架構主要包括冷熱錢包隔離、多重簽名、兩步驗證、 密鑰保存機制、外部密碼審核機制等。
劍橋大學Judge商學院發布的研究報告（2017 Global Cryptocurrency Benchmarking Study）對數字貨幣交易所的安全因素提供了以下調查數據：
· 交易所的安全團隊平均占團隊總人數的13%，平均花費17%的預算用于保證交易所安全運行。
· 幾乎所有的交易所都采用冷熱錢包隔離機制，將95%的幣值儲存在冷錢包中，只預留5%的貨幣用于提現充值，Mt.Gox的
比特幣被盜的主因即是當時還沒有采用冷熱錢包隔離機制。
· 70%的交易所聘用了外部安全團隊，在外部密碼審核、多重簽名錢包、在兩步驗證等方面展開合作。
交易所的安全保障機制是技術能力和運營能力的結合，對安全團隊的技術能力和運營經驗均提出了很高的要求。
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