但不可否認，新的 Web 3.0 世界存在很重大的問題：低效。這與區塊鏈從業者們認可的 Web 3.0 去中心化運行有直接關系，去中心化的效率相較于中心化的 Web 2.0 和傳統意義上的 Web 3.0 來說，都要低的很多。
首先是去中心化網絡對于任務處理的速度低下，這一點區塊律動 BlockBeats 認為，任何區塊鏈行業的從業者都會表示認可，即便是那些號稱 Web 級的區塊鏈項目也無法掩蓋效率低的事實；然后是使用去中心化網絡需要支付的隱性成本，進入 Web 3.0 的用戶都會被「手續費」概念給弄糊涂，原本的互聯網根本不存在手續費這件事。
Web 3.0 要對用戶科普的內容要遠遠超過區塊鏈、比特幣、加密貨幣要科普的知識。當然，開發者也可以通過多樣的設計將應用程序設計的和傳統 App 無異，讓用戶根本感覺不到這些復雜的運行機制的存在。但這類開發工具，才剛剛起步。
Web 3.0 的普及難度可能很大，無論是對開發者的普及，還是對用戶的普及，還是對企業的普及，都將異乎常規的難。尤其是在如今全球各個國家和地區都試圖加強互聯網監管的時代，Web 3.0 正在與政客們進行對抗。
再加上通證經濟和人性自私，炒幣遠比做項目賺錢。為了取得大眾信任，開發團隊甚至需要定期露面來證明自己還在工作。如何把區塊鏈運行得跟傳統互聯網一樣，同時又能保持區塊鏈的特性，是目前區塊鏈開發者們仍在頭疼和探索的難題。
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