自2015年以來，業界就一直在測試航運
區塊鏈的應用。一些大型港航企業，如馬士基、現代商船、上港集團、中遠海運已與科技巨頭合作，創建區塊鏈航運系統，以簡化海運物流。但是區塊鏈在技術層面、應用層面、監管層面、安全層面都面臨著諸多挑戰。
在技術層面，區塊鏈面臨的障礙主要體現在高額可持續性成本方面。區塊鏈持續運行所帶來的
能源消耗，可能遠遠超過它最終為解決航運
供應鏈短板所帶來的效益。此外，由于區塊鏈網絡規模擴大、增加新區塊后的交易費用巨大，也必須考慮到大量的計算資源耗費。
應用層面，能夠實現高吞吐、高并發服務速度的區塊鏈系統，將是構建全球航運信息網絡的助推劑。然而，區塊鏈在航運供應鏈體系中的應用，除
數字貨幣外，落地項目仍舊不多，進行實踐的應用大多也屬于探索性項目，難以形成持續性的商業模式。同時，區塊鏈在全球航運網絡中的運作需要遵守不同的法律法規，實現區塊鏈與航運供應鏈的完美結合是一項極其復雜的任務。
監管層面，作為一種顛覆性的信息技術，區塊鏈在全球各領域的運營均面臨監管標準缺失、監管技術不足以及監管經驗缺乏的局面，區塊鏈體系結構的分布式特性在為特定用例提供明顯優勢的同時，也對市場的整體控制和治理提出了巨大的挑戰。在出現明顯安全漏洞時，沒有中央機構可以聯系，并且缺乏法律、管理當局以及用戶的認可，加之技術的不成熟、單一的基礎標準和概念的難以掌握，基本的信息隱私得不到保障，這對本就復雜的航運體系又是一大考驗。
安全層面，在滿足市場交易多元化需求的背后，航運企業更多是要保證系統交易和用戶信息的安全。
區塊鏈技術是通過開放源代碼來提高網絡的可信性，但源代碼的開放也意味著攻擊者對系統的攻擊變得更加容易。盡管區塊鏈使用公開密鑰加密進行交易認證和執行，可如果一方丟失或無意中發布私鑰，系統并沒有提供額外的安全機制。同時，航運系統中的智能合約具備運行成本低、人為干預風險小等優勢，但若是智能合約的設計存在問題，將可能帶來較大的損失。
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