一是難以篡改，更加安全。在傳統信息系統的安全方案中，安全依賴于層層設防的訪問控制。通過
區塊鏈技術，記錄交易的數據庫任何人都可以訪問，但由于巧妙的設計并輔以密碼學和共識機制，區塊鏈的數據記錄方式使得修改某一數據需要變更所有的后續數據記錄，難度極大。實踐證明，這樣一個數據庫可以確保市值達千億美金的
比特幣，在全球黑客的攻擊下，運轉穩定。
二是異構多活，可靠性強。區塊鏈每個系統參與方都是一個異地多活節點，是天生的多活系統。如果某個節點遇到網絡問題、硬件故障、軟件錯誤或者被黑客控制，均不會影響系統以及其他參與節點。區塊鏈中的節點通過點對點的通信協議進行交互，在保證通信協議一致的情況下不同節點可由不同開發者使用不同的編程語言、不同版本的全節點來處理交易。由此構成的軟件異構環境確保了即便某個版本的軟件出現問題，區塊鏈的整體網絡不會受到影響，這也是其高可用的基石所在。
三是具備智能合約，自動執行。智能合約具有透明可信、自動執行、強制履約的優點。盡管如此，自尼克·薩博1993年提出以來，智能合約始終停留在理念層面。重要原因在于，長久以來沒有支持可信代碼運行的環境，無法實現自動強制執行。而區塊鏈第一次讓智能合約的構想成為現實。
四是網狀直接協作機制，更加透明。區塊鏈提供了不同于傳統的方法，以對等的方式把參與方連接起來，由參與方共同維護一個系統，參與方職責明確，無需向第三方機構讓渡權利，有利于各方更好的開展協作。作為信任機器，區塊鏈有望成為低成本、高效率的一種全新的協作模式，形成更大范圍、更低成本的新協同機制。
雖然區塊鏈有上述優點，也很好地達到了比特幣的預定設計目標，支撐了比特幣系統的正常運行。但也正因為區塊鏈技術早期主要是服務于比特幣，在某些方面有著明顯的短板和不足。
一是性能和擴展性不能滿足要求，從目前的情況來看，區塊鏈的性能問題主要表現為吞吐量及存儲帶寬遠不能滿足整個社會的支付需求。同時，比特幣隨著時間的推移，累積的交易數據越來越大，對于普通電腦的存儲來說，這是個不小的負擔。如果只是簡單提高區塊大小來提高吞吐量，比特幣很快就會變成只有少數幾個大公司能夠運行的系統，有違去中心化的設計初衷。在比特幣、
以太坊等公有鏈系統中，上述矛盾是系統設計時面臨的最大挑戰。
在
聯盟鏈中，因為參與記賬的節點可選可控，最弱節點的能力上限不會太低，并且可以通過資源投入獲得改善，再針對性地替換掉共識算法等組件最終獲得性能的全方位提升。但作為智能合約基礎支撐的聯盟鏈另有考驗：智能合約運行時會互相調用并讀寫區塊數據，因此交易的處理時序特別重要，如果只能逐筆進行，這會嚴重制約節點的處理能力。
二是數據隱私和訪問控制有待改進。現有公有鏈中，各參與方都能夠獲得完整數據備份，所有數據對于參與方來講是透明的，無法使參與方僅獲取特定信息。比特幣通過隔斷交易地址和地址持有人真實身份的關聯，達到匿名效果。所以雖然能夠看到每一筆轉賬記錄的發送方和接受方的地址，但無法對應到現實世界中的具體某個人。對于比特幣而言，這樣的解決方案也許夠用。但如果區塊鏈需要承載更多的業務，比如登記實名資產，又或者通過智能合約實現具體的借款合同，這些合同信息如何保存在區塊鏈上，驗證節點在不知曉具體合同信息的情況下如何執行合同等等，目前業內尚未有成熟方案。而這些問題在傳統信息系統中并不存在。
三是治理機制有待完善。公有鏈社區摸索出了“硬分叉”和“軟分叉”等升級機制，但遺留問題有待觀察。由于公有鏈不能“關停”，其錯誤修復也異常棘手，一旦出現問題，尤其是安全漏洞，將非常致命。
實際上，通過放松去中心化這個限制條件，很多問題能找到解決的方案。比如在聯盟鏈這樣的多中心系統中，通過關閉系統來升級區塊鏈底層，或者緊急干預，回滾數據等，必要時都是可用的手段，這些手段有助于控制風險、糾正錯誤。而對于常規代碼升級，通過分離代碼和數據，結合多層智能合約結構，實現可控的智能合約更替。
互聯網近年來的迅猛發展及其與物理世界的深度耦合與強力反饋, 已經根本性地改變了現代社會的生產、生活與管理決策模式。可以預見的是，未來在中心化和去中心化這兩個極點之間，將會存在一個新的領域，各種區塊鏈系統擁有不同的非中心化程度，以滿足不同場景的特定需求。
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